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Categoría: Investigación

La Apoptina es una proteína pequeña del virus de la anemia de pollo que induce apoptosis (suicido célular programado) en más de 80 tipos de células tumorales, pero no afecta a las células sanas. Por ello, se considera a la Apoptina como un fármaco prometedor y se encuentra en fase de ensayos clínicos. No obstante, su fuerte tendencia a oligomerizar reduce su capacidad de entrar en las células e impide los estudios estructurales. Por ello, hemos preparado y caracterizado una variante monómerica de la Apoptina que conserva, en gran medida, la actividad anti-tumoral de la proteína silvestre. Utilizando la RMN, mostramos que esta variante es desordenada y dinámica en escalas de tiempo de ps-ms. El ensamblaje conformacional no se altera significativamente por fosforilación, adición de Mg++, cambios de pH, o condiciones redox. Estos resultados apoyan un modelo para el mecanismo de acción de la Apoptina en el cual ciertas quinasas específicas de células tumorales fosforilizan la Apoptina, lo que lleva a su acumulación en el núcleo y la activación de la apoptosis de tipo p53-independiente.

Referencias:

1. "Insights into the mechanism of Apoptin's exquisitely selective anti-tumor action from atomic level characterization of its conformation and dynamics." Ruiz-Martínez S, Pantoja-Uceda D, Castro J, Vilanova M, Ribó M, Bruix M, Benito A, Laurents DV. Arch Biochem Biophys. (2017) 614:53-64.
doi:10.1016/j.abb.2016.12.010

2. "A truncated Apoptin protein variant selectively kills cancer cells." Ruiz-Martínez S, Castro J, Vilanova M, Bruix M, Laurents DV, Ribó M, Benito A. Invest New Drugs (2017).
doi:10.1007/s10637-017-0431-6

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Categoría: Investigación

El complejo formado por el sensor neuronal de Ca2+ NCS-1 y el factor intercambiador de guanina Ric8a co-regulan de manera antagónica el número de sinapsis y la probabilidad de liberación de neurotransmisor, siendo por tanto potenciales dianas terapéuticas para enfermedades de la sinapsis, tales como el síndrome del “X frágil” (FXS), la forma más común de autismo hereditario. La combinación de estudios cristalográficos y cribados virtuales ha permitido encontrar una pequeña molécula derivada de la fenotiazina capaz de inhibir la interacción entre estas dos proteínas, con una superficie de contacto grande y compleja. La administración del compuesto reduce el aberrantemente elevado número de sinapsis y mejora el aprendizaje en un modelo de mosca del síndrome del cromosoma X frágil. Además, los estudios de relación estructura-función han demostrado el mecanismo de acción de esta molécula. Este trabajo abre la puerta al desarrollo de nuevos fármacos para tratar enfermedades neuronales con alteración de la sinapsis, como en el caso del autismo y el Alzheimer.

Este trabajo ha sido realizado por investigadores de tres centros del CSIC (el Instituto de Química-Física “Rocasolano”, el Instituto Cajal y el Centro de Investigaciones Biológicas) y el Centro de Investigaciones Biomédicas “Alexander Fleming” de Grecia.

Alicia Mansilla, Antonio Chaves-Sanjuan, Nuria E. Campillo, Ourania Semelidou, Loreto Martínez-González, Lourdes Infantes, Juana María González-Rubio, Carmen Gil, Santiago Conde, Efthimio M. C. Skoulaki, Alberto Ferrús, Ana Martínez, María José Sánchez-Barrena. “Interference of the complex between NCS-1 and Ric8a with phenothiazines regulates synaptic function and is an approach for fragile X syndrome”. Proc. Nat. Acad. Sci., PNAS (2017).
doi:10.1073/pnas.1611089114
Nota de prensa de EFE
Nota de prensa del CSIC

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Categoría: Investigación

Existe una conexión compleja entre el reciclaje de la pared bacteriana y la manifestación de resistencia a antibióticos β-lactámicos en muchas enterobacterias y Pseudomonas aeruginosa. Este proceso está mediado por productos específicos del reciclaje de la pared (muropétidos) que son internalizados en el citoplasma y reconocidos por el regulador transcripcional AmpR para la expresión de la enzima β-lactamasa clave en la resistencia a antibióticos. Mediante una combinación de diferentes técnicas (cristalografía de rayos X, espectrometría de masas y dinámica molecular) hemos caracterizado el dominio de unión al efector (EBD) de AmpR. Nuestros resultados proporcionan información crucial sobre el reconocimiento de los muropéptidos que desencadenan la resistencia y revisan el dogma establecido hasta el momento. Este trabajo es parte de un esfuerzo colaborativo entre el IQFR y la Universidad de Notre Dame (Indiana, USA).

Dik, D.A.; Domínguez-Gil, T.; Lee, M.; Hesek, D.; Byun, B.; Fishovitz, J.; Boggess, B.; Hellman, L.M.; Fisher, J. F.; Hermoso, J.A.; Mobashery, S. “Muropeptide Binding and the X-Ray Structure of the Effector Domain of the Transcriptional Regulator AmpR of Pseudomonas aeruginosa”. J. Am. Chem. Soc. (2017).
doi:10.1021/jacs.6b12819

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Categoría: Investigación

Hemos estudiado las propiedades termoquímicas [1] y electrónicas [2] de especies químicas halogenadas, de especial relevancia en diversos procesos atmosféricos (p.ej. en la destrucción catalítica del ozono y calidad del aire).
Encontramos, por una parte, que cálculos ab initio del tipo Gn (Gaussian-n, n=3,4) son una excelente alternativa para determinar valores precisos de calores de formación y energías de enlace carbono-halógeno de una amplia variedad de especies orgánicas incluyendo cloro y bromo [1]. Estos datos serán posteriormente implementados en modelos climáticos para la evaluación del impacto atmosférico de dichos compuestos.

Por otra parte, mostramos que la metodología CASPT2 (“Complete Active Space Self Consistent Field Perturbation Theory”) permite determinar valores fiables de parámetros ópticos de absorción (en el rango UV-Visible) de especies representativas como IBr o HgBr2 que tienen particular connotación en procesos fotoquímicos de la atmósfera [2].

[1] J.Z. Dávalos, R. Notario, C.A. Cuevas, J.M. Oliva, A. Saiz-Lopez: “Thermochemistry of halogen-containing organic compounds with influence on atmospheric chemistry”. Comp. Theor. Chem. 1099 (2017) 36-44. DOI:10.1016/j.comptc.2016.11.009
[2] S.P. Sitkiewicz, J.M. Oliva, J.Z. Dávalos, R. Notario, A. Saiz-Lopez, D.R. Alcoba, O.B. Oña, D. Roca-Sanjuán; “Ab initio quantum-chemical computations of the electronic states in HgBr2 and IBr: Molecules of interest on the Earth's atmosphere”. J. Chem. Phys. 145 (2016) 244304, 1-14. DOI:10.1063/1.4971856

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Categoría: Premios

Alejandro Manjavacas Arévalo ha sido distinguido con el Premio a Investigadores Noveles 2016 de la Real sociedad Española de Física-Fundación BBVA

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Categoría: Noticias

Alfonso Saiz-López, Investigador Científico CSIC y Jefe del Departamento de Química Atmosférica y Clima de este Instituto, ha obtenido 2 M euros del programa “Consolidator Grant 2016” (ERC, European Research Council) para desarrollar el proyecto “Climate dimension of natural halogens in the Earth system: Past, present, future (CLIMAHAL)” a lo largo de los próximos 5 años.
Como resultado de un proceso de selección extremadamente competitivo, el programa “Consolidator” del ERC financiará 314 proyectos (24 en España) que destacaron entre las 2300 solicitudes recibidas por su notable contribución a la creación de nuevos conocimientos. En el caso específico del Proyecto CLIMAHAL, se propone utilizar un vasto conjunto de métodos espectroscópicos, cinéticos y de modelado teórico para determinar por primera vez cómo intervienen radicales y otras especies moleculares conteniendo halógenos, que tienen un origen natural, en los procesos que modulan el clima de nuestro planeta, en diferentes épocas históricas.
Los proyectos “Consolidator Grant” del Consejo Europeo de Investigación (ERC) se convocan cada año para apoyar la investigación de científicos ya consolidados y reconocidos como excepcionales, de cualquier nacionalidad y edad. El ERC selecciona proyectos pioneros y de alto riesgo que abran nuevos caminos en sus respectivos campos de investigación o en otros dominios.

Enlace a la nota de prensa del ERC

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Categoría: Noticias

IPERION CH (http://www.iperionch.eu/) is a program with participation of 11 countries of the European Union, among them Spain through CSIC, and USA. The main objective of IPERION CH is to provide to researchers in Heritage Science a network of installations and laboratories in Europe that supports the advance of knowledge and innovation in the preservation of Cultural Heritage. This objective encompasses the offer of transnational access to first order instruments and diagnostic methods, in an integrated platform that includes large installation and mobile laboratories, and to important data archives.

Researchers of the LANAMAP Group at IQFR participate in joint research activities of IPERION CH aiming at 1) advancing new techniques and instruments, mainly based in laser methods, for non-invasive stratigraphic analysis, 2) integration of analytical techniques in portable instruments, and 3) development of diagnostic techniques for monitoring deterioration and conservation treatments.

IPERION CH pursues the integration of European world-class facilities to create a cohesive entity playing a leading role in the global community of Heritage Science. For this reason, IPERION CH has applied for inclusion in the ESFRI (European Strategy Forum on Research Infrastructures) roadmap trough the E-RIHS PP (European Research Infrastructure for Heritage Science Preparatory Phase) proposal, approved in March of this year (http://www.e-rihs.eu/). In the near future, IPERION CH will work towards fulfilling all conditions necessary to establish a European Research Infrastructure that will give continuity to IPERION CH.

Finally, PARTHENOS (http://www.parthenos-project.eu/) is a program integrated by with 15 partners and designed to strengthening the cohesion of research in the broad sector of Humanities, Cultural Heritage, Archaeology and related fields through a thematic cluster of European research infrastructures, integrating initiatives, e-infrastructures and other world-class infrastructures. Strong links between the activity of PARTHENOS and IPERION CH are been established in the parallel running of these two projects.

More information in: http://bit.ly/2fe1D93

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Categoría: Noticias

IPERION CH (http://www.iperionch.eu/) es un programa en el que participan 11 países de la Unión Europea, entre ellos España a través del CSIC, y Estados Unidos. El principal objetivo de IPERION CH es proporcionar a los investigadores en Ciencia del Patrimonio una red de instalaciones y equipamientos en Europa que les permita avanzar en sus proyectos. Dicho objetivo se cumple mediante la oferta de acceso transnacional a herramientas y métodos de diagnóstico de primer orden, en una plataforma integrada que incluye grandes instalaciones y laboratorios móviles, así como importantes archivos de datos.

Investigadores del grupo LANAMAP del IQFR participan en las actividades conjuntas de investigación en IPERION CH enfocadas a: 1) al avance de nuevas técnicas e instrumentos, principalmente basadas en métodos láser, para el análisis estratigráfico no invasivo, 2) a la integración de técnicas analíticas en instrumentos portátiles, y 3) al desarrollo de técnicas de diagnóstico para la monitorización del deterioro y de los tratamientos de conservación.

Con la intención de establecer una única infraestructura de investigación Europea en Ciencia del Patrimonio, en el contexto de la iniciativa ESFRI (European Strategy Forum on Research Infrastructures)se presentó la propuesta E-RIHS PP (European Research Infrastructure for Heritage Science Preparatory Phase). Tras su aprobación en marzo de este año (http://www.e-rihs.eu/), será posible dar los primeros pasos para establecer el funcionamiento de los aspectos científicos, administrativos y políticos de una infraestructura estable que dé continuidad a IPERION CH.

Finalmente PARTHENOS (http://www.parthenos-project.eu/) es un proyecto integrado por 15 socios Europeos que pretende fortalecer la cohesión de la investigación en los amplios sectores de las Humanidades, la Ciencia del Patrimonio, la Arqueología y campos relacionados mediante la agrupación temática de infraestructuras de investigación europeas, iniciativas integradoras, e infraestructuras virtuales. La importante conexión entre la actividad de PARTHENOS e IPERION CH se manifiesta en el desarrollo en paralelo de ambos proyectos.

Más información en http://bit.ly/2fe1D93